Outil pour décoder/encoder les codons ADN/ARN. Un codon est un groupe de 3 nucléotides parmi (A, C, G et U) pour l'ARN ou (A, C, G et T) pour l'ADN (code génétique).
Codons (Code Génétique) - dCode
Catégorie(s) : Système de Notation, Biologie
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Un codon est une suite de 3 molécules/nucléotides décrivant un acide aminé dans le séquençage de l'ADN ou l'ARN messager (ARNm) ou de transfert (ARNt). Chaque nucléotides est décrite par une lettre (parmi A,C,G,T,U) et le codon peut donc être décrit par ces 3 lettres, mais aussi par le nom de l'acide aminé.
Les lettres A,T,C,G,U des bases azotées signifient respectivement Adénine, Thymine, Cytosine, Guanine et Uracile.
Le chiffrement par code génétique utilise la table des codons et transforme les codons d'ADN ou ARN en leur code d'acide aminé selon les abréviations officielles IUPAC (Union internationale de chimie pure et appliquée) et IUBMB (Union of Biochemistry and Molecular Biology).
Code | ADN/DNA | ARN/RNA |
---|---|---|
A | GCT, GCC, GCA, GCG | GCU, GCC, GCA, GCG |
B | AAT, AAC, GAT, GAC | AAU, AAC, GAU, GAC |
C | TGT, TGC | UGU, UGC |
D | GAT, GAC | GAU, GAC |
E | GAA, GAG | GAA, GAG |
F | TTT, TTC | UUU, UUC |
G | GGT, GGC, GGA, GGG | GGU, GGC, GGA, GGG |
H | CAT, CAC | CAU, CAC |
I | ATT, ATC, ATA | AUU, AUC, AUA |
J | ||
K | AAA, AAG | AAA, AAG |
L | TTA, TTG, CTT, CTC, CTA, CTG | UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG |
M | ATG | AUG |
N | AAT, AAC | AAU, AAC |
O | ||
P | CCT, CCC, CCA, CCG | CCU, CCC, CCA, CCG |
Q | CAA, CAG | CAA, CAG |
R | CGT, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG | CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG |
S | TCT, TCC, TCA, TCG, AGT, AGC | UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC |
T | ACT, ACC, ACA, ACG | ACU, ACC, ACA, ACG |
U | ||
V | GTT, GTC, GTA, GTG | GUU, GUC, GUA, GUG |
W | TGG | UGG |
X | ||
Y | TAT, TAC | UAU, UAC |
Z | CAA, CAG, GAA, GAG | CAA, CAG, GAA, GAG |
* | TAA | UAA |
Il existe 22 acides aminés protéinogènes, il est donc possible d'encoder seulement 22 lettres. Il existe un codon spécial, le codon stop qui est codés par un astérisque *.
Exemple : ADN peut s'écrire CGG CTG TTA
Certains codons décrivent 2 acides aminés différents
Codon(s) | Lettres possibles |
---|---|
AAT,AAC,AAU | B,N |
CAA,CAG | Q,Z |
GAC,GAT,GAU | D,B |
GAA,GAG | E,Z |
Le message est composé des lettres A, C, G, T et U, souvent par groupe de 3.
Les lettres A, C, G, T sont utilisées par l'ADN tandis que les lettres A, C, G, U pour l'ARN (y compris ARNm et ARNt).
La liste des acides aminés est
A | Alanine | Ala |
C | Cystéine | Cys |
D | Acide aspartique | Asp |
E | Acide glutamique | Glu |
F | Phénylalanine | Phe |
G | Glycine | Gly |
H | Histidine | His |
I | Isoleucine | Ile |
K | Lysine | Lys |
L | Leucine | Leu |
M | Méthionine | Met |
N | Asparagine | Asn |
O | Pyrrolysine | Pyl |
P | Proline | Pro |
Q | Glutamine | Gln |
R | Arginine | Arg |
S | Sérine | Ser |
T | Thréonine | Thr |
U | Sélénocystéine | Sec |
V | Valine | Val |
W | Tryptophane | Trp |
Y | Tyrosine | Tyr |
ADN signifie Acide DésoxyriboNucléique et ARN Acide RiboNucléique, ils font partie des molécules les plus importantes en biologie des êtres vivants car elles contiennent l'information génétique héréditaire.
L'abréviation ARNm signifie ARN messager.
L'abréviation ARNt signifie ARN de transfert.
Les processus de transcription ou la réplication des codons, utilisent la complémentarité des bases azotées qui forment des paires codon-anticodon : A-T (pour l'ADN), A-U (pour l'ARN), C-G, G-C, T-A, U-A.
Les nucléotides ont une masse molaire de :
C (cytosine) | 111 |
U (uracile) | 112 |
T (thymine) | 126 |
A (adenine) | 135 |
G (guanine) | 151 |
Les nucléotides ont une densité de :
T | 1.23 |
U | 1.32 |
C | 1.55 |
A | 1.60 |
G | 2.20 |
Le codons sont consitués de 4 caractères distincts A, C, G, T ou A, C, G, U.
Les références au code génétique (ADN, ARN, les expériences etc.) ou plus généralement à la biologie (protéines, double hélice) sont des indices.
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